چند مسئله باعث شده که هزینه اجرای این سیستم مخصوصا در کشور ما را بالا ببرد و در نتیجه است.قبال کمتری از این سیستم در مقایسه با سایر تجهیزات سرمایشی و گرمایشی صورت بگیرد که مهمترین آنها عبارتند از : اعمال هزینه های بیشتر در واردات این دستگاه ها به خاطر تحریم ها، وابستگی شدید قیمت این محصول به ارز، وجود تکنولوژی های مدرن در راستای کاهش مصرف و افزایش عمر سیستم و اثر مستقیم آن بر قیمت ساخت دستگاه، افزایش چشمگیر هزینه نصب آن (استفاده از تعداد زیادی Y branch و لوله مسی در مسیر نصب سیستم)

با بهره گیری از تکنولوژی تزریق بخار در نسل چهارم سیستم تهویه مطبوع vrf ال جی ، ظرفیت گرمایش دستگاه درصد افزایش یافته است.. این دستگاه قادر خواهد بود حتی در شرایطی که دمای هوای محیط به ۵ درجه سانتی گراد زیر صفر می رسد ، گرمابخش محیط داخل اتاق باشد.

یكی از بزرگترین معایب اینكه کولرگازی مولتی اسپلیت معمولاً انرژی بیشتری نسبت به تهویه مطبوع تک اسپلیت مصرف می کند، بنابراین مهم است. که ظرفیت هر کولر گازی اسپلیت با دقت انتخاب شود تا بازده انرژی حفظ شود.خلاصه ای از معایب سیستم:

سیستم VRF جزو پیشرفته ترین و البته گرانترین سیستم های تهویه مطبوع به شمار می آید. برنامه پذیری، راندمان بالا، نیاز به فضای کمتر جهت نصب و اجزای کمتر نسبت به دیگر سیستم های مشابه، دستگاه VRF را در دنیا به دستگاهی قابل اتکا در صنعت تهویه مطبوع تبدیل کرده است..

) در صورت کوچکترین نشتی گاز در مسیر لوله کشی کل سیستم دچار مشکل می شود ( به دلیل عدم توازن و فشار گاز درون شاخه ها) و فرایند تولید سرما جهت کلیه ی یونیت های داخلی دچار اختلال می شود. پیدا کردن نشتی لوله مسی بسیار سخت و هزینه بر است. چرا که مبرد های مورد است.فاده در VRF بدون بو و بدون رنگ هستند و احتمال تخریب جهت مشخص شدن محل نشت و عیب یابی لوله مسی صدمه دیده بسیار زیاد است. و باید آن قسمت که دچار نشتی شده تعویض گردد.